人单细胞转录组测序数据库介绍

        单细胞RNA测序技术(single-cell RNA-seq technologies)的应用，积累了大量临床样本的单细胞转录水平的数据，在细胞水平揭示了不同细胞类型的转录谱，不同的疾病类型不同的组织来源，有着明显的细胞异质性。因此，有系统的和层次的整理不同细胞类型的基因表达的数据就显得十分重要。

        来自中国的两个实验室在单细胞转录组数据库的建设上做出了亮眼的工作。一个是西北工业大学计算机学院彭佳杰教授团队，建立了SC2disease database(http://easybioai.com/sc2disease/ )，该数据库包括946 481条记录，包括通过scRNA-seq测序获得的25种与疾病相关特定表达的基因集。所有的细胞来自29个组织，可以分到341个细胞群。另一个是同济大学的张帆教授团队，他们建立了一个肿瘤免疫单细胞库(TISCH, http://tisch.comp-genomics.org)，收集了约200万个细胞涵盖27种肿瘤类型，这些数据来自79个高质量的scRNA-seq测序数据集。用户可以查看不同细胞类型，病人和组织来源，治疗方式和疗效在单细胞水平的基因表达可视化差异；