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单细胞DNA-seq
技术简介:
MissionBio 高通量单细胞靶向DNA测序能够在单细胞水平检测基因拷贝数变化、单碱基突变、插入缺失及蛋白质表达等,充分展现细胞间遗传异质性,助力肿瘤的耐药机制研究,揭示肿瘤发展轨迹、克隆结构,鉴定及纯化基因编辑产物等。2018年,获美国The Scientist评选的10大科技创新产品奖。
技术原理:
MissionBio的Tapestri平台基于微液滴的微流控装置,利用油包水体系对细胞进行捕获与封装。封装时,细胞和蛋白酶等会被一起装入微液滴中,每一个微液滴相当于一个微容器。之后,细胞在微液滴中进行裂解、加条形码(barcoding)等步骤,再结合靶向 PCR 扩增技术,对特定的DNA目标序列进行单细胞水平的建库。建库完成后,即可进行高通量测序和后续的生物信息学分析。
技术特点:每个细胞可捕获>300个目标区段的DNA序列;
高灵敏度,可检测含量低至0.1%的罕见亚克隆,以及突变的合子型和突变共发生情况;
多种检测类型,可检测SNV、InDel及CNV等多种变异类型;
高通量,每个样本可测量5,000 ~ 10,000细胞;
灵活性强,可定制化设计疾病基因检测靶点及CRISPR靶点;
实验周期:从收到组织或细胞样本开始至拿到数据,周期为20个工作日;
定制Panel周期:2-4周
数据质量:PE150进行测序,测序质量Q30≥80%,
标准数据分析:
服务代码:4base-scDNA-seq
订购指南:order@4basedx.com