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单细胞甲基化组测序scRRBS

DNA甲基化是最早发现的基因表观修饰方式之一,真核生物中的甲基化仅发生于胞嘧啶,即在DNA甲基化转移酶(DNMTs)的作用下使CpG二核苷酸5’-端的胞嘧啶(C)转变为5’-甲基胞嘧啶(5mC), 其参与调控了基因表达。在哺乳动物体内,DNA甲基化在分化细胞中相对稳定;相比之下,在早期胚胎发育和原始生殖细胞发育过程中会发生基因组范围的去甲基化和DNA甲基化谱式的再建立。    

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特异甲基化PCR扩增实验服务(Methylation-Specific PCR)

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服务代码:4base-Methyl-PCR

订购指南:order@4basedx.com


全基因组染色质开放区域测序Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing (ATAC-Seq)

DNA的复制转录是需要将DNA的紧密结构打开,从而允许一些调控因子结合(转录因子或其他调控因子)。多数基因组中的染色质都紧紧盘绕在细胞核内,但也有一些区域经染色质重塑后呈现出松散的状态,这部分无核小体的裸露DNA区域被称为开放染色质(open chromatin),而DNA复制和基因转录都发生在这些区域。染色质的这种特性叫做染色质的易接近性(chromatin accessibility),或者开放性,通过研究细胞特定状态下开放的染色质区域可以在DNA水平上了解其转录调控。

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开放染色质的研究方法有很多,如ATAC-seq、DNase-Seq、MNase-seq及FAIRE-seq等。相比较于其他技术,ATAC-Seq所需细胞量少,利用Tn5转座酶切割未结合核小体或蛋白基因组区域,所需细胞量少,实验步骤简单,可以在全基因组范围内检测染色质的开放状态、核小体位置及TF结合位点,目前已经成为研究染色质开放性的首选技术方法。加上10xGenomics最近推出了一款新的产品—10xscATAC-seq(10x单细胞ATAC测序)。


服务代码:4base-ATAC-seq

订购指南:order@4basedx.com